Rasmus Kristoffer Pedersen
Velkommen til mit personlige website. Her finder du mit CV og links til forskellige ting jeg har lavet.
Jeg er ansat som PostDoc på Roskilde Universitet og er del af PandemiX forskningscentret, hvor vi undersøger historiske pandemier og COVID-19 pandemien.
Læs mere om PandemiX her.
I min Ph.D. arbejdede jeg med matematisk modellering af MPN, som del af Cancitis forskningsgruppen.
Læs mere om Cancitis her.
Forskellige links:
Videnskabelige Artikler
"Temperate climate malaria in nineteenth century Denmark"
Mathias Mølbak Ingholt, Tzu Tung Chen, Franziska Hildebrandt, Rasmus K. Pedersen, Lone Simonsen
"Dose‐dependent mathematical modeling of interferon‐α‐treatment for personalized treatment of myeloproliferative neoplasms"
Rasmus K. Pedersen, Morten Andersen, Trine A. Knudsen, Vibe Skov, Lasse Kjær, Hans C. Hasselbalch, Johnny T. Ottesen
"Mathematical modelling of the hematopoietic stem cell-niche system: Clonal dominance based on stem cell fitness"
Rasmus K. Pedersen, Morten Andersen, Thomas Stiehl, Johnny T. Ottesen
"Mathematical Modeling of MPNs Offers Understanding and Decision Support for Personalized Treatment."
Johnny T. Ottesen, Rasmus K. Pedersen, Marc J. B. Dam, Trine A. Knudsen, Vibe Skov, Lasse Kjær, Morten Andersen
"Data-driven analysis of JAK2V617F kinetics during interferon-alpha2 treatment of patients with polycythemia vera and related neoplasms"
Rasmus K. Pedersen, Morten Andersen, Trine A. Knudsen, Zamra Sajid, Johanne Gudmand-Hoeyer, Marc J. B. Dam, Vibe Skov, Lasse Kjær, Christina Ellervik, Thomas S. Larsen, Dennis Hansen, Niels Pallisgaard, Hans C. Hasselbalch, Johnny T. Ottesen
"Bridging blood cancers and inflammation: The reduced Cancitis model"
Johnny T. Ottesen, Rasmus K. Pedersen, Zamra Sajid, Johanne Gudmand-Hoeyer, Katrine O. Bangsgaard, Vibe Skov, Lasse Kjær, Trine A. Knudsen, Niels Pallisgaard, Hans Carl Hasselbalch, Morten Andersen
"Mathematical Modelling as a Proof of Concept for MPNs as a Human Inflammation Model for Cancer Development"
Morten Andersen, Zamra Sajid, Rasmus K. Pedersen, Johanne Gudmand-Hoeyer, Christina Ellervik, Vibe Skov, Lasse Kjær, Niels Pallisgaard, Torben A. Kruse, Mads Thomassen, Jesper Troelsen, Hans Carl Hasselbalch, Johnny T. Ottesen
Oplæg, præsentationer og lignende
"Modelling Hematopoietic Stem Cells and their Interaction with the Bone Marrow Micro-Environment."
Videnskabelig Talk (Aflyst grundet Corona-Virus)
"Modelling Hematopoietic Stem Cells and their Interaction with the Bone Marrow Micro-Environment."
Online videnskabelig talk til "Statistics and Biomathematics Seminar"
"Modelling hematopoietic stem cells and their interaction with the bone marrow micro-environment."
Videnskabelig talk til "The First Nordic Biomathematics Days"
"Modelling hematopoietic stem cells and their interaction with the bone marrow micro-environment."
Videnskabelig talk til "Stem Cell Modelling Day"
"Modelling the Dynamics of Hematopoietic Stem Cells"
Poster til "SIAM Conference on Applications of Dynamical Systems"
"Modelling of Quiescent Stem Cells in Relation to Myeloproliferative Neoplasms"
Poster til "European Conference on Mathematical and Theoretical Biology"
Yderlig videnskabelig formidling
I løbet af 2021, skrev jeg en række formidlingsartikler til et bredt publikum, udgivet på videnskab.dk. En komplet liste kan findes her.
"Communicating Science and Mathematics with Interactive Visualizations"
Talk ved DataViz CPH meetup
"Interaktive Visualiseringer til Videnskabelig Formidling - Hvordan matematiske modeller gøres forståelige ved hjælp af interaktive simuleringer"
VIDEO LINK
IDA webinar
"Communicating Science with p5.js - How interactive simulations and creative coding can make the complex relatable"
Oplæg til "Processing Community Day 2020"
"The benefits of building and working with interactive simulations - Interactive simulations for better model intuition"
Blog post for "Mathematical Oncology" blog
Uddannelse
PhD - Matematisk modellering af myeloproliferative neoplasier
Kandidat i matematik og fysik
- Speciale: "Uformaliserede Matematiske Problemer"
Specialet undersøgte hvilket læringsmæssige potentiale der ved brug af en særlig type matematiske problemer i undervisning; Uformaliserede problemer. Problemerne er karakteristike ved at de kræver en matematisk undersøgelse af de studerende før udregninger kan foretages. Konkret blev der taget udgangspunkt i calculus.
Projektarbejder: - "Investigation of polystyrene-b-polyisoprene using broadband dielectric spectroscopy" - Kandidatsemesterprojekt i fysik
I projektet blev diblock copolymeren "polystyrene-b-polyisoprene" undersøgt eksperimentielt ved hjælp af bredbånd dielektrisk spektroskopi. Forsøg og databehandling blev selv udført. - "On the strategies used to attack unsolved mathematical problems" - Kandidatsemestersprojekt i matematik
Projektet bestod af en overordnet gennemgang af en lang række matematiske artikler for at få indblik i hvordan forskellige matematiske discipliner bruges til udforskning af et uløst matematisk problem. Problemet der blev undersøgt er problemet kendt som Collatz' Conjecture.
Bachelor i matematik og fysik
- Udvalgte projekter:
- "Matematisk modellering af mæslinger" - Femte semesterprojekt i matematik.
Projektet bestod konkret i en udvikling af en udvidet SEIR compartment-model. Formålet var at undersøge vaccinationsratens indvirkning på spredningen af mæslinger i en befolkning lig Danmarks, samt at sammenligne resultater med virkeligt data for registrerede sygdomstilfælde. - "Simulation of DNA-induced Self-assembly of Nanoparticles" - Bachelorprojekt i fysik.
Projektet havde til mål at undersøge spontane grupperinger af specifikke molekyler i nanostørrelse ved at studere en avanceret molekylesimulering samt ved at udvikle en simplificeret molekylesimulering. Den simple simulering baseredes på en Monte-Carlo algoritme til simulering af Brownsk bevægelse.
HTX
Fysik A / Matematik A linje
Erfaring
Videnskabelig assistent ved Institut for Naturvidenskab og Miljø
PostDoc ved PandemiX forskningscentret
Kursusunderviser - "Mathematical modelling and dynamic systems"
Hjælpelærer - BK2
Hjælpelærer - Calculus
Hjælpelærer - BK1
Udvikler af og aktiv del af Science Show
Årsvikariat Matematikunderviser
Kompetencer og andet
IT-Kompetencer
- Python - Megen erfaring
- MATLAB - Megen erfaring
- LaTeX - Megen erfaring
- C# - Lidt erfaring
- Java - Lidt erfaring
- Microsoft Excel - Megen erfaring
- General web-udvikling (HTML, Javascript, CSS) - Nok til at kunne lave denne hjemmeside.
Sprog
- Dansk - Modersmål
- Engelsk - Flydende mundtligt og skriftligt
- Tysk - Begynder
Friviligt Arbejde
- Medlem af formandskabet - Rusvejledningen 2014 Roskilde Universitet
- Tutor for naturvidenskabelig linje - Rusvejledningen 2013 Roskilde Universitet
- Tutor for humanistisk linje - Rusvejledningen 2012 Roskilde Universitet